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益生菌是一类通过改善宿主肠道微生物菌群的平衡而发挥作用的活性微生物，是人体肠道重要的生物菌，能够促进肠内微生物菌群的生态平衡，具有改善肠道菌群结构、促进肠道中有益菌的增殖。抑制有害菌的生长、消除致癌因子、提高机体免疫力、降低胆固醇等重要生理功效，对于高血压、高血脂、心脏病、糖尿病和癌症的防治有着重要意义。
随着人们保健意识的增强及微生态学相关科技的发展，消费者也越来越意识到益生菌在促进人体健康和预防疾病方面的重要性。尤其近几年，益生菌在功能性食品中的开发应用成为功能食品的一个研究热点，并将成为功能食品发展的重要领域。
复合菌株，利用其互生关系，可以有很多优点。嗜乳酸杆菌在生长中需要醋酸盐、维生素B2和叶酸等作为营养物质，而双歧杆菌在发酵中除了能生成醋酸外，还能生成维生素B1、B2、B12和叶酸等多种维生素，刚好供给嗜酸乳杆菌的需要，促进嗜酸乳杆菌的生长增殖;嗜酸乳杆菌在微含氧的乳基质中生长快，可以逐步降低乳基质中氧化还原电位，并提供各种易分解利用的物质促进双歧杆菌的生长;同时，混合培养可以加快产酸，缩短了凝乳时间，且凝乳风味更佳。两菌在混合培养中有良好的生态关系。
在高度工业化的国家，消费者对“功能食品”和“营养保健品”的需求已呈增长态势，正缓慢、坚实地渗透到许多发展中国家的高收入消费阶层。含益生菌的功能食品也被视为重要的一类产品。
功能食品中常见益生菌主要指两大类乳酸菌群：一类为双歧杆菌，另一类是乳杆菌。现在成功上市的功能食品有很多，如婴儿食品及欧美国家将益生菌添加到强化食品中制成饮料粉末、果汁;有的制成片剂、胶囊等易携带和食用。膳食补充剂作为益生菌的另一类产品，如酸奶、冰淇淋等被广大消费者接受。
复合益生菌新技术的应用也在加快。目前国内对复合益生菌在保健食品这一领域的应用已达到一定的阶段，随着国外越来越多的大型益生菌公司进驻中国，和国内外专业科研队伍的不断深入研发，复合益生菌在科技应用上一定能突破更高的层次。
在自然的、健康的功能食品已成为21世纪食品主流，具有保健功能的复合益生菌将为功能食品行业的发展开辟更宽广的前景。
