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作为肠道有益菌的“滋补剂”，该如何选择益生元呢？
一是纯度，二是来源。
益生元种类很多，有低聚糖、多糖、植物中草药提取物、蛋白质水解物、多元醇等，其纯度越高越好，但纯度越高，价格也就会越高。如果是作为日常的保健，纯度稍低一点无妨；如果用来治疗疾病，那就需要含量80%以上的益生元。如果蔗糖、葡萄糖含量超过40%，那糖尿病人就要慎用。有人也许会说，日常保健我也要用纯度最 高的，行不行？当然可以，只要您经济情况允许。
来源不同，功能性低聚糖的品质也会有差异。有些功能性低聚糖甜度为蔗糖的30%~60%；有些功能性低聚糖的理化性质与蔗糖相似，故可代替砂糖用于食品制造，以调节甜度、粘度、冰点，改善食品口感与保湿性、水活度等，并增加其保健功能。
如何挑选益生元？
益生元的来源是多方面的。不过，人们一般从天然物中提取益生元。如，棉子糖是从甜菜汁或甜菜废糖蜜中提取的，水苏糖是由植物水苏提取的，大豆低聚糖是从去除大豆蛋白的大豆乳清中提取的。
因酸水解无专一性，产品中糖类复杂，不易得到特定的低聚糖，工业上大量生产的益生元是利用生物技术的酶法水解或转移反应制造的，例如低聚异麦芽糖、低聚果糖、低聚半乳糖、低聚壳聚糖等。
